Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms