Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd4P06332 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd4P06332 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms