Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms