Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt1P04104 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt1P04104 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt1P04104 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms