Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-AaP01910 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms