Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01652 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01652 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01652 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01652 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01652 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01652 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01652 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01652 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01652 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01652 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01652 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01652 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01652 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms