Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sp1O89090 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp1O89090 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms