Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn3O88705 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcn3O88705 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms