Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms