Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3aO88508 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms