Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vti1bO88384 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vti1bO88384 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms