Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp4O70480 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms