Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lnx1O70263 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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