Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrxO55103 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrxO55103 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrxO55103 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrxO55103 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrxO55103 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrxO55103 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrxO55103 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrxO55103 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrxO55103 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms