Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syngr1O55100 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms