Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Pole2O54956 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pole2O54956 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms