Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16O54909 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rdh16O54909 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rdh16O54909 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rdh16O54909 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh16O54909 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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