Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atp10aO54827 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp10aO54827 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms