Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CrxO54751 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CrxO54751 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CrxO54751 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CrxO54751 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms