Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nek2O35942 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms