Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pik3cdO35904 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms