Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atf6bO35451 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Atf6bO35451 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atf6bO35451 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atf6bO35451 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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