Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Prrt1O35449 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Prrt1O35449 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt1O35449 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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