Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcc1O35379 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms