Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn1O35350 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn1O35350 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn1O35350 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms