Protein–RNA interactions for Protein: O35188

Cx3cl1, Fractalkine, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cl1O35188 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cx3cl1O35188 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cx3cl1O35188 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cx3cl1O35188 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cx3cl1O35188 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cx3cl1O35188 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cx3cl1O35188 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cx3cl1O35188 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cx3cl1O35188 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cx3cl1O35188 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cx3cl1O35188 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cx3cl1O35188 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cx3cl1O35188 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms