Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ArxO35085 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ArxO35085 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ArxO35085 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ArxO35085 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArxO35085 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArxO35085 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArxO35085 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArxO35085 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArxO35085 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArxO35085 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ArxO35085 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms