Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klf6O08584 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klf6O08584 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf6O08584 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf6O08584 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf6O08584 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf6O08584 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf6O08584 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf6O08584 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf6O08584 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf6O08584 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf6O08584 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf6O08584 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms