Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20878L7N244 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20878L7N244 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms