Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2056J3QQ02 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms