Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2035J3QP87 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm2035J3QP87 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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