Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm10428J3QNV7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm10428J3QNV7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm10428J3QNV7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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