Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bbip1J3QMK2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bbip1J3QMK2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bbip1J3QMK2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bbip1J3QMK2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bbip1J3QMK2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bbip1J3QMK2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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