Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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