Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20830J3KML6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20830J3KML6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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