Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4bG5E8Z2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms