Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms