Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgxb3G3X9M3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms