Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm28048F7BCN0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm28048F7BCN0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm28048F7BCN0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28048F7BCN0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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