Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crocc2F6XLV1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crocc2F6XLV1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms