Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms