Protein–RNA interactions for Protein: E9QAE1

Nckap5, NCK-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5E9QAE1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nckap5E9QAE1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms