Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc7bE9Q9Y3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7bE9Q9Y3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms