Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TrdnE9Q9K5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms