Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms