Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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DspE9Q557 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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DspE9Q557 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DspE9Q557 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms