Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trip11E9Q512 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trip11E9Q512 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms