Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r238E9Q373 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms