Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzd2E9Q1M1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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