Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms